Isolierung von Bakteriophagen gegen geflügelpathogene Bakterien als alternativer Ansatz zur Verminderung des Einsatzes von Antibiotika in der Hähnchenmast
Zwei der häufigsten bakteriellen Erreger in der kommerziellen Geflügelfleischproduktion sind Streptokokken und Enterokokken. Die Auswahl wirksamer Antibiotika ist aufgrund der zunehmenden Anzahl von Enterococcus-Stämmen mit Resistenzen gegenüber einzelnen oder mehreren Wirkstoffgruppen eingeschränkt. Die Folge sind erhöhte Mortalitätsraten und reduzierte wirtschaftliche Erträge durch hohe Verwurfsraten am Schlachthof. Aufgrund der häufig vorkommenden, intrinsischen- und erworbenen Resistenzen stellt die Behandlung von Enterococcus-Infektionen bei Geflügel sowohl für die Behandlung als auch das Tiergesundheitsmanagement eine große Herausforderung dar. Besonders relevant sind im One-Health Bereich Resistenzen gegenüber dem Glykopeptid-Antibiotikum Vancomycin und weiteren Wirkstoffen dieser Klasse. Durch das zoonotische Potential von Vancomycin-resistenten Enterokokken stellen diese auch in der Humanmedizin eine zunehmende Bedrohung für die öffentliche Gesundheit dar. Seit der Entwicklung von antibiotikaresistenten Erregern hin zu einer globalen Krise, gewinnt die Erforschung von antimikrobiellen-Alternativen, wie beispielsweise dem Einsatz von Phagen, zunehmend an Bedeutung. Phagen sind Viren, die Bakterienspezies oder -stämme spezifisch abtöten, ohne jedoch Organismen oder Zellen anderer Arten zu infizieren.Die Phagentherapie ist eine seit vielen Jahren bekannte antibakterielle Behandlungsmethode. Durch die in der therapeutischen Anwendung ausbleibenden Nebenwirkungen beziehungsweise Toxizität, erregte die Phagentherapie als Antibiotika-Ersatz und –Ergänzung in den letzten Jahren großes Interesse und stellt einen vielversprechenden Behandlungsweg dar.Innerhalb der vorliegenden Dissertation wurde das Vorkommen von Enterococcus-Phagen in Geflügelbeständen untersucht. Die hierzu isolierten Bakterienisolate wiesen gegenüber den in der Geflügelpraxis gängigen Antibiotika hohe Resistenzraten auf. Dabei wiesen über ein Drittel der Isolate Resistenzen gegen Lincospectin und Enrofloxacin auf. Zweiundneunzig Prozent der Enterococcus-Feldisolate waren resistent gegenüber dem Makrolid-Antibiotikum Tylosin. Insgesamt wurden 66 Proben aus kommerziellen Broilerbeständen, Legehennenherden und Hobbytierhaltungen entnommen und auf vorhandene Phagen untersucht. Die Hälfte der 16 in dieser Studie isolierten lytischen Phagen stammte aus ökologisch bewirtschafteten Betrieben. Hierbei stellte frischer Enddarmkot das Probenmaterial mit der höchsten Phagen-Isolierungsrate dar (68,7 %). Die isolierten Phagen zeigten am häufigsten gegenüber E. faecalis eine Wirkung (30,3 %). Bei der anschließenden Untersuchung der Wirtsspektren wurden 25 Bakterienisolate auf ihre Empfindlichkeit gegenüber den 16 isolierten Phagen getestet. Die Phagen Φ 4 und Φ 16 wiesen hierbei das breiteste Wirkspektrum mit einer hohen Effektivität auf. Zusätzlich infizieren diese und die Phagen Φ 1, Φ 2, Φ 7 fünf weitere Bakterienstämme mit der gleichen Effektivität wie ihren Wirtstamm. Die Phagen Φ 2, Φ 4, Φ 8, Φ 10, Φ 16 verfügen über eine lytische Wirkung gegenüber mehr als zehn verschiedenen Bakterienstämmen. Weiterhin konnten Phagen isoliert werden, die abgesehen von Enterococcus (E.) faecalis auch geflügelpathogene E. hirae, E gallinarum und E. durans Stämme infizieren. Die in dieser Arbeit konnte die Existenz von Enterococcus-Phagen mit einer Plaquebildung auf mehreren geflügelpathogenen Enterococcus-Stämmen ermittelt werden. Die erzielten Ergebnisse liefern neue Erkenntnisse zum Vorkommen und dem Wirtsbereich von Enterococcus-Phagen. Durch die Kombination mehrerer Phagen zu einem Phagen-Cocktail erweitert sich das Spektrum von Bakterien, die durch eine Anwendung behandelt werden können. Die bisher an einigen Phagen durchgeführten Genomanalysen geben Rückschlüsse auf ihre sequenzbasierte Ähnlichkeit. Die oben beschriebenen Ergebnisse deuten darauf hin, dass der therapeutische Einsatz von Phagen als alternative zu Antibiotika wirksam sein kann. Dies ist hinsichtlich der hohen Resistenzraten bei Enterococcus-Isolaten ein vielversprechender Therapieansatz, der zukünftig unter Praxisbedingungen erforscht werden sollte.
Two of the most common bacterial pathogens in commercial poultry meat production are Streptococci and Enterococci. The choice of effective antibiotics is limited due to the increasing number of Enterococcus strains with antibiotic resistance to one or more groups of substances. The results of treatment failure are increased mortality rates and lower economic returns due to high condemnation rates in abattoirs. Because of the frequent intrinsic and acquired resistance, the treatment of Enterococcus infections in poultry poses a major challenge for both treatment and animal health management. In One Health, resistance to the glycopeptide antibiotic vancomycin and other agents of this class is particularly relevant. Due to the zoonotic potential of vancomycin-resistant enterococci, they constitute an increasing threat to public health in human medicine. As antibiotic-resistant pathogens have become a global crisis, studies exploring and investigating antibiotic alternatives, such as the use of bacteriophages, is becoming increasingly important. Bacteriophages are viruses that specifically kill bacterial species or strains, but without infecting organisms or cells of other species. Phage therapy has been a well-known antibacterial treatment in medicine for many years. Due to the lack of side effects or toxicity in its therapeutic application, phage therapy is attracting great interest for substituting or complementing classical antimicrobials and thus represents a promising future. In this dissertation, the occurrence of Enterococcus–specific phages in poultry flocks was investigated. The bacterial field isolates for this purpose showed high resistance rates to the antibiotics commonly used in poultry farming. More than a third of the isolates were resistant to enrofloxacin und lincospectin. isolates. In addition, Ninety-two percent of the Enterococcus field showed a resistance to the macrolide antibiotic tylosin. A total of 66 samples were collected from commercial broiler flocks, layer flocks and hobby farms and analysed for the presence of bacteriophages. Half of the 16 isolated lytic phages came from organically managed farms. In this case, fresh rectal faeces proved to be the sample material with the highest phage isolation rate (68.7 %). Among the isolated phages, lytic effects against E. faecalis were most frequent (30.3 %). In the subsequent host range studies, 25 bacterial isolates were tested for the sensitivity of the 16 isolated bacteriophages. Phages Φ 4 and Φ 16 showed the broadest spectrum of activity with high efficiacy. In addition, these and phages Φ 1, Φ 2, Φ 7 infect five other bacterial strains with the same efficacy as their host strain. Bacteriophages Φ 2, Φ 4, Φ 8, Φ 10, Φ 16 have lytic activity against more than ten different bacterial strains. Furthermore, phages could be isolated which, in addition to Enterococcus (E.) faecalis, also infect the poultry-pathogenic strains E. hirae, E gallinarum and E. durans. The phages isolated in this work show the existence of Enterococcus-specific phages with activity against several poultry pathogenic Enterococcus isolates. The results obtained provided new insights into the occurrence and host range of Enterococcus phages. By combining several phages into a phage cocktail, the spectrum of infected bacteria was broadened. The genome analyses of some phages carried out so far allowed to draw conclusions about their sequence-based similarity. The results described above suggest that the therapeutic use of bacteriophages may be effective as an alternative to antibiotics. Given the high resistance rates in Enterococcus-specific infections, this is a promising therapeutic approach that should be investigated in future studies under practical conditions